处理农村宅基地房屋动迁补偿纠纷的方法是：

1、协商，因农村宅基地房屋动迁补偿发生纠纷的双方当事人可以通过协商解决；

2、调解，通过村委会调解解决纠纷；

3、仲裁，当事人不愿协商、调解或协商、调解不成的可以向仲裁机构申请仲裁；

4、诉讼，根据纠纷内容直接向人民法院提起诉讼。

民法典农村宅基地房屋确权的标准有哪些

民法典规定，房屋作为不动产，其物权是以登记为准的，所以农村房屋确权的标准是办理房屋确权登记。

《中华人民共和国民法典》

第二百零九条【不动产物权登记的效力】不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。

依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。

第二百三十三条【物权纠纷解决方式】物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。

第二百三十四条【物权确认请求权】因物权的归属、内容发生争议的，利害关系人可以请求确认权利。

《土地管理法》第十四条

土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。