软件的著作权人可以向著作权管理部门举报公司盗版著作权，让著作权管理部门查处，收集盗版的证据，著作权人也可以向法院申请调查，对相关证据进行保全。

《中华人民共和国著作权法》

第五十一条为制止侵权行为，在证据可能灭失或者以后难以取得的情况下，著作权人或者与著作权有关的权利人可以在起诉前向人民法院申请保全证据。

人民法院接受申请后，必须在四十八小时内作出裁定；裁定采取保全措施的，应当立即开始执行。

人民法院可以责令申请人提供担保，申请人不提供担保的，驳回申请。

申请人在人民法院采取保全措施后十五日内不起诉的，人民法院应当解除保全措施。

《中华人民共和国民事诉讼法》

第六十四条证明责任和职权探知

当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。当事人及其诉讼代理人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。人民法院应当按照法定程序，全面地、客观地审查核实证据。

一、公司使用盗版软件被查出会怎么判

实际中，如果是个人使用盗版软件，软件权利人会因为单个的软件侵权，损失较少，而且要求维权的成本一般比较高，所以通常是不会去管，但是如果是企业用户这种使用软件人数较多的话，那么基本你被查出来的话，就会被认定非法复制著作权人软件的侵权行为，为此要承担一定的行政责任、民事责任甚至刑事责任。

你需要承担的民事责任包括停止侵害、消除影响、赔礼道歉和赔偿损失。其中停止侵害、消除影响，一般就是要求你停止使用侵权软件，赔礼道歉则根据软件著作权所有人的要求在指定的媒体上刊登道歉信。

与此同时，你就损失的赔偿，有下列三种计算方式：

1、按照权利人的实际损失给予赔偿。也就是按照你盗版的软件的所有权人的实际损失确定，其实，就是你盗版他们多少软件，本来按照正常途径购买软件的话，你需要花多少钱就基本上是了。

2、按照侵权人的违法所得给予赔偿。这里的侵权人就是指使用盗版软件企业用户，这种计算还是较为简单的，你作为侵权人，自己也能大概估算出来

3、利用“法定赔偿”，在权利人的实际损失或者侵权人的违法所得不能确定时，有去法院起诉了的，那么法院就会根据侵权行为的情节，判决你五十万元以下的赔偿。

一般不管是违法所得还是实际损失，要是时间较长的话，会比较难确定，所以，法院那边为了能够避免出现这种情况，就会采用这种方式了。