学校无权扣在编教师的工资，但存在以下情形之一的，学校可以扣除签订劳动合同的教师工资：代扣代缴个人所得税；代扣代缴五险一金应当由劳动者支付的部分；因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失，通过扣除工资补偿损失；其他。

《工资支付暂行规定》第十五条

用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：

（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；

（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；

（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；

（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。