达到以下标准妨害动植物防疫罪才能立案：

1、非法处置疫区内易感动物或者其产品，货值金额5万元以上的；

2、非法处置因动植物防疫、检疫需要被依法处理的动植物或其产品，货值金额2万元以上的；

3、非法调运、生产、经营感染重大植物检疫性有害生物的林木种子、苗木等繁殖材料或者森林植物产品的；

4、其他标准。

《最高人民检察院公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）》第五十九条

违反有关动植物防疫、检疫的国家规定，引起重大动植物疫情的，应予立案追诉。

违反有关动植物防疫、检疫的国家规定，有引起重大动植物疫情危险，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：

（一）非法处置疫区内易感动物或者其产品，货值金额5万元以上的；

（二）非法处置因动植物防疫、检疫需要被依法处理的动植物或者其产品，货值金额2万元以上的；

（三）非法调运、生产、经营感染重大植物检疫性有害生物的林木种子、苗木等繁殖材料或者森林植物产品的；

（七）其他情节严重的情形。