妨害植物防疫罪要达到的立案标准有：非法处置疫区内易感动物或者其产品，货值金额5万元以上的；非法处置因动植物防疫、检疫需要被依法处理的动植物或者其产品，货值金额2万元以上的；非法调运、生产、经营感染重大植物检疫性有害生物的林木种子、苗木等繁殖材料或者森林植物产品的；法定其他立案情形。

妨害植物防疫罪咋样处置

（1）犯妨害植物防疫罪情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。

（2）单位犯妨害植物防疫罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照自然人的规定处罚。

（3）犯妨害植物防疫罪的，一般要求达到情节严重的标准。

《最高人民检察院公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）的补充规定》第九条第二款

违反有关动植物防疫、检疫的国家规定，有引起重大动植物疫情危险，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：

（一）非法处置疫区内易感动物或者其产品，货值金额5万元以上的；

（二）非法处置因动植物防疫、检疫需要被依法处理的动植物或者其产品，货值金额2万元以上的；

（三）非法调运、生产、经营感染重大植物检疫性有害生物的林木种子、苗木等繁殖材料或者森林植物产品的。