强拆养殖场是否违法要根据法律适用程序而定，由法院作出判决强拆的就是合法的。根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第26条规定：房屋征收部门与被征收人在征收补偿方案确定的签约期限内达不成补偿协议，或者被征收房屋所有权人不明确的，由房屋征收部门报请作出房屋征收决定的市、县级人民政府依照本条例的规定，按照征收补偿方案作出补偿决定，并在房屋征收范围内予以公告。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》第28条规定：被征收人在法定期限内不申请复议或者不提起行政诉讼，在补偿决定规定的期限内又不搬迁的，由作出房屋征收决定的市、县级人民政府依法申请人民法院强制执行。

一、合法强拆需要履行的程序

第一，被征收人与房屋征收部门在补偿方案规定的期限内达不成补偿协议，或者被征收房屋所有权人不明确。

第二，这时房屋征收部门会报请作出房屋征收决定的市、县级人民政府作出补偿决定，并送达给被征收人；

第三，被征收人收到房屋征收补偿决定后，在法定期限内不申请复议或者不提起行政诉讼，在补偿决定规定的期限内又不搬迁；法院受理拆迁方强制执行申请后，会询问拆迁方和拆迁户双方的基本情况，调取相关证据来对征收补偿决定的合法性，合理性以及可执行性进行审查。

第四，由作出房屋征收决定的市、县级人民政府依法申请人民法院强制执行；

第五，人民法院收到申请后进行审查，符合法定条件的，人民法院依法作出准予执行裁定；不符合条件的，人民法院依法作出不准予执行裁定。

第六，强拆既可以由作出征收补偿决定的市、县级人民政府组织实施，也可以由人民法院执行，实践中大多数情况是由市、县级人民政府组织实施。