劳动者违反制度时，公司可以通过记过、处分、降职等进行处理。留下该员工违反规章制度的证据，可以是证人证言，拍照，但最好的是让该员工自己出一个事情经过的说明，或者是请求公司从轻处理的报告。总之，目的都是为了留下他确实存在违反规章制度的证据；掌握证据后，再看劳动者违反规章制度的情节。如果情节比较轻，而且该员工的悔过态度较好，公司可以通报、处罚、降薪、降级等措施；如果情节严重，构成严重违反公司规章制度，公司可以解除和他的劳动关系。

违反制度处罚措施与责任追究办法

违反制度时，可根据实际情况处记过、处分等处罚；用人单位可以要求劳动者赔偿。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。用人单位与劳动者约定服务期的，不影响按照正常的工资调整机制提高劳动者在服务期期间的劳动报酬。

《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：

（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；

（二）严重违反用人单位的规章制度的；

（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；

（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；

（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；

（六）被依法追究刑事责任的。