在大多数情况下，仅有部分条款的失效并不必然导致整份协议无效。

在双方达成一致意见且合同得以修改之后，合同依然能够保持完整有效的效力。

若无法协商一致，那么仅有部分条款可能会受到影响而失效。

部分条款仍然可以视为相对独立的组成部分，通常情况下，当这部分条款发生失效时，应依据法律规范进行处理；

若是没有相关法律规定，也应该参考行业内约定俗成的规则来执行。

然而，以下三种情形需要特别注意：

第一，如果部分条款侵犯到了国家安全利益或者涉嫌泄露国家机密等严重问题，那么该合同就会被判定为全部无效。

其次，部分条款还属于与合同关键要素密切相关的诸如当事人姓名和住所以及标的物的数量与质量等八大主要条款之一。

最后，如果在合同签订过程中，任何一方当事人是在受到威胁或压迫的情况下非自愿地签署合同的。

如果满足上述条件中的任意一条，该合同即从签约之日起开始被认定为无效。

《民法典》第一百五十六条

民事法律行为部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。

《民法典》第一百五十三条

违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。违背公序良俗的民事法律行为无效。