参保人在医疗保险年度内累计中断参保超过3个月的，医疗保险重新计算。医疗保险参保人中断缴纳医疗保险费的，自中断缴交的次月1日起，停止享受医疗保险统筹基金支付的医疗保险待遇，但是个人账户余额还可以继续使用。参保人恢复缴纳医疗保险费后，缴交医疗保险费的次月1日起可享受规定的医疗保险待遇。

医保断交三个月余额会清零吗

医保断交三个月余额不会清零，但是会有所影响，具体如下：

1、影响农民住院报销，如果不断缴，农民生病住院只要达到了报销标准就会给报销一定比例的医药费，如果断缴了就失去了这方面的权利；

2、买药要自费。交了新农合农民就可以使用保障卡到药店买药，如果断缴，保障卡就失效了，农民买药只能自费；

3、会影响后续新农合的上缴。如果年年上缴，新农合方面就会有个良好的记录，而如果中间断缴了，后续想续交就会比较麻烦，可能需要相关的证明。相应的办理程序：

（1）本人申请并积极缴纳合作医疗款；

（2）村委会审核并向镇合管站提交筹资花名册、筹资票据；

（3）镇合疗办复查，审核合疗筹资表，向县合疗中心提出申请签证；

（4）县合疗经办中心审核无误后，办理签证、盖章、登录，确认。

法律依据：《中华人民共和国保险法》第二十四条

保险人依照本法第二十三条的规定作出核定后，对不属于保险责任的，应当自作出核定之日起三日内向被保险人或者受益人发出拒绝赔偿或者拒绝给付保险金通知书，并说明理由。

第二十五条

保险人自收到赔偿或者给付保险金的请求和有关证明、资料之日起六十日内，对其赔偿或者给付保险金的数额不能确定的，应当根据已有证明和资料可以确定的数额先予支付；保险人最终确定赔偿或者给付保险金的数额后，应当支付相应的差额。

《中华人民共和国城镇职工基本医疗保险条例》第十九条从业人员缴纳的基本医疗保险费全部计入其个人帐户。

用人单位缴纳基本医疗保险费的２５—３５％用于建立退休人员和从业人员的个人帐户，具体分配办法由省人民政府按照顾年长者原则制定；所余资金用于建立统筹基金。

第二十条基本医疗保险基金实行收支两条线管理，纳入社会保险基金财政专户，专款专用，全部用于从业人员和退休人员的基本医疗，不得挪作他用。