一、发生农民工工伤赔偿纠纷该如何办

1、发生农民工工伤赔偿纠纷，劳动者可以向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动仲裁委员机构申请仲裁，并提交双方存在劳动关系等材料；若对仲裁裁决不服的，可以依法提起诉讼。

2、法律依据：《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》

第二条中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法：

（一）因确认劳动关系发生的争议；

（二）因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议；

（三）因除名、辞退和辞职、离职发生的争议；

（四）因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议；

（五）因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议；

（六）法律、法规规定的其他劳动争议。

二、工伤事故赔偿哪些费用

1、医疗费，住院费。

2、职工住院治疗工伤的伙食补助费，以及经医疗机构出具证明，报经办机构同意，工伤职工到统筹地区以外就医所需的交通、食宿费用从工伤保险基金支付，基金支付的具体标准由统筹地区人民政府规定。

3、一次性伤残补助金从工伤保险基金按伤残等级支付一次性伤残补助金。

4、一次性工亡补助金一次性工亡补助金标准为上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍。

《劳动争议调解仲裁法》第二条