区别在于权利归属不同：土地所有权，归属集体；承包权，归属农户；经营权，归属经营者。

1、首先，关于土地的所有权是由我国国家性质所决定的。我国宪法明确规定“农村和城市郊区的土地，除由法律规定属于国家所有的以外，属于集体所有；宅基地和自留地、自留山，也属于集体所有”。因此，农村土地集体所有权的根本地位坚持不变。

2、其次，土地承包经营权属于用益物权。在权利内容上，多数观点认为，土地承包经营权系承包权与经营权的双重属性混合。其中，承包权属于成员权，只有集体成员才有资格拥有，具有身份依附性和不可对外转让性；经营权属于财产权，在权利属性上具有可交易性。

3、由此，在“两权分置”下，土地所有权和土地承包经营权其实并不具备自由流转的物权属性。但“三权分置”体制实现了集体、承包农户、新型经营主体对土地权利的共享，从法律制度的角度看，其本质就是确定在不改变土地公有制的基本经济制度前提下，在土地上分离出一个更加符合市场交易要求的私权——土地经营权。

一、土地承包经营权是什么

土地承包经营权：是公民集体对全民所有制或者集体所有制单位使用的国有土地的承包经营权。权利主体为公民或者集体；权利对象为集体所有土地或者国家所有权由全民所有制单位或者集体所有制单位使用的国有土地；权利内容由合同约定。土地承包经营权是具有利益物权性质的民事权利。主要原因是：承包经营权表现为直接控制土地等物的权利。承包经营权具有排他性。承包经营权具有优先性和追及性。