不可以，年终奖属于劳动报酬的范围，只要员工符合公司规章制度规定发放年终奖的条件，公司就应当发放年终奖。公司提出协商解除劳动合同的要支付经济补偿金，经济补偿金不能用年终奖抵扣。如果公司没有合法理由单方解除劳动合同，员工可以要求支付赔偿金。公司的做法不合法，有劳动争议的可以去劳动局投诉或者去劳动仲裁委申请劳动仲裁。企业的规章制度不能与现行法规相违背。年终奖一般是单位对在职职工干一年工作的奖励，由企业自主掌握。经济补偿金是指劳动合同解除时，企业依据劳动法规的相关规定，给职工一定数额的经济补偿。职工如果未解除劳动合同，就不存在领取经济补偿金这一说法。经济补偿金分段计算：在劳动合同法施行前签订，试行后解除的劳动合同，依照劳动合同法规定应当支付经济补偿的，经济补偿年限自2008年1月1日起计算，劳动合同法施行前按照当时有关规定执行。经济补偿金计算年限：对于因用人单位的合并、兼并、合资、单位改变性质、法人改变名称等原因而改变工作单位的，其改制前的工作时间可以计算为“在本单位的工作时间。另外，劳动者非因本人原因从原用人单位被安排到新用人单位工作的，劳动者在原用人单位的工作年限合并计算为新用人单位的工作年限。原用人单位已经向劳动者支付经济补偿的，新用人单位在依法解除、终止劳动合同计算支付经济补偿的工作年限时，不再计算劳动者在原用人单位的工作年限。经济补偿金计算基数：经济补偿金中的月平均工资是指劳动者在解除劳动合同前12个月的月实际平均工资，而不仅仅是劳动合同中约定的基本工资。根据劳动部《关于贯彻执行若干问题的意见》的规定，“工资”是指用人单位依据国家有关规定或劳动合同的约定，以货币形式直接支付给本单位劳动者的劳动报酬，一般包括计时工资、计件工资、资金、津贴和补贴、延长工作时间的工资报酬以及特殊情况下支付的工资等。年终奖一般都是公司自治的，并不是法律强制性规定的，但是经济补偿金是法律强制性规定的，所以二者是不可以代替的。经济补偿金是因为用人单位没有正当理由将员工辞退，存在过错，应当给予受损害员工补偿。