（一）工程预付款支付流程

1、施工单位提交预付款《工程款支付申请表》给预算专员，施工单位项目经理要签字确认；

2、预算办根据合同约定的预付比例审核预付款，签署预付款《工程款支付申请表》然后交给财务部；

3、财务部再次复核后，交给总经理和董事长审批，然后将审核审批通过的《工程款支付申请表》交给出纳安排付款。

（二）工程进度款支付流程：

1、施工单位先向工程部提交进度款《工程款支付申请表》，要求附上已完工程的预算书，一式叁份（工程部、预算办、财务部各一份），施工单位项目经理要签字。

2、工程部审核当月完成的部位及项目及相关工程量，审核完毕由工程部经理签字后交到预算专员。

3、预算专员审核已完成工程量，并审核工程预算价，确定当月完成工程造价，根据合同约定，审批工程款，然后预算专员签字确认。（注：预算办要求提供电子版预算书时，施工单位要积极配合。）

4、预算专员将进度款《工程款支付申请表》上交财务部审核。

5、财务部审核无误后，将进度款《工程款支付申请表》交由总经理和董事长审批。

6、施工单位根据审核审批通过的进度款《工程款支付申请表》中的金额开具当地建安发票，发票需按进度款《工程款支付申请表》中的工程项目分别填开。

7、施工单位将审核审批通过的进度款《工程款支付申请表》以及相同金额的建安发票上交到财务部，财务部再次复核《工程款支付申请表》的金额是否与发票金额一致，以及核对发票的各项内容后，交到出纳处办理该款项的转付。

8、其他注意事项：

（1）施工单位要提供开户信息并加盖公章，开户信息内容有：单位名称、合同编号、开户名称、行号、账号、开户行。

（2）工程预算书要按单位工程分开，并且而且设备基础的土建工程与房屋的土建工程要分开。

（三）工程结算款支付流程：

1、施工单位向工程部提交《工程款支付申请表》（必须经施工单位项目经理签字并加盖印章）

2、现场工程师核实本次请款的实际完成工程数量及工程质量，并签署《工程款支付申请表》

3、工程部经理核实工程质量和数量并签署《工程款支付申请表》

4、工程完工后，由施工单位向预算专员提交电子版的结算书，同时提供相应的设计变更、与工程造价相关工作联系单、工程签证单等。

5、预算专员根据图纸及设计变更、工作联系单、工程签证单等进行审核，经双方共同确认后，由预算专员出一份结算书，并复核已付款、扣款和本次付款金额与工程进度、合同的一致性后，确定实际应结算的金额，然后签署《工程款支付申请表》。

6、分部工程进度验收结算应有《工程质量竣工验收记录》和《工程验收合格证书》，单位工程竣工结算款支付时还应具备《工程竣工报验表》、《工程竣工报告》、《工期核定报告》。

7、预算专员将结算款《工程款支付申请表》及相关的审核上交财务部审核。

8、财务部再次复核已付款、扣款和本次付款金额与工程进度、合同的一致性后，确定实际应结算的金额，审核无误后将结算款《工程款支付申请表》交由总经理和董事长审批。

9、施工单位根据已通过审核审批的《工程款支付申请表》开具建安发票。发票金额为本次完成工程造价金额（不含甲供材）扣减已开票金额。开具的发票必须有税务局的签章以及施工单位的发票专用章。

10、如果工程结算涉及甲供材的，预算办需按定额中所耗用的量，以及财务提供的单价计算所用甲供材金额，并提供给施工单位，由施工单位开具建安发票时将甲供材税金一并开具。

11、施工单位将审核审批通过的结算款《工程款支付申请表》以及相同金额的建安发票上交到财务部，财务部再次复核《工程款支付申请表》的金额是否与发票金额一致，以及核对发票的各项内容后，交到出纳处办理该款项的转付。

如何进行支付工程进度款

（1）工程款（进度款）在双方确认计量结果后14天内，发包方应向承包方支付工程款（进度款）。按约定时间发包方应扣回的预付款，与工程款（进度款）同期结算。

（2）符合规定范围的合同价款的调整，工程变更调整的合同价款及其他条款中约定的追加合同价款，应与工程款（进度款）同期调整支付。

法律依据：《建设工程合同司法解释》

第三条

建设工程施工合同无效，且建设工程经竣工验收不合格的，按照以下情形分别处理：

（一）修复后的建设工程经竣工验收合格，发包人请求承包人承担修复费用的，应予支持；

（二）修复后的建设工程经竣工验收不合格，承包人请求支付工程价款的，不予支持。因建设工程不合格造成的损失，发包人有过错的，也应承担相应的民事责任。