让开具发票的公司拿原件复印一份，到双方所在地税务机关开具证明。

丢失增值税发票的处理方法：对购货方取得销货方开具的防伪税控增值税专用发票发生丢失的，由销货方向主管税务机关提出申请，向销货方主管税务机关开具《已抄报税证明单》，由销货方将已抄报税证明单、发票复印件交给购货方(你公司)进行发票认证及抵扣进项税款。

但对开票日期已超过90天的增值税专用发票，不得开具已抄报税证明，也不得开具红字发票，根据你反映的情况未超过90天，可以认证抵扣税款并用复印件入帐，如购货方已将认证并已抵扣联进行税款抵扣而发生丢失的.应向主管税务机关报告

一、发票联有什么作用

发票联，作为购买方核算采购成本和增值税进项税额的记账凭证；抵扣联，作为购买方报送主管税务机关认证和留存备查的凭证；记账联，作为销售方核算销售收入和增值税销项税额的记账凭证。其他联次用途，由一般纳税人自行确定。各联的作用：第一联：存根联，销货方留存备查。第二联：发票联，购货单位作付款的记账凭证。第三联：税款抵扣联，购货方作扣税凭证。第四联：记账联，销货方作销售的记账凭证。

二、开出来的发票能不能补开

发票是可以补开的。发票丢了有以下两种处理方法：1、增值税票丢失：把存根联复印，交客户当地主管税务局确认并出具未抵扣税证明，报本公司主管税务局后，开具红字发票冲原开发票，再重新填开发票给客户。如果已抵扣税不得重开。2、普通发票丢失，复印存根联并盖章给客户入账。财务人员应该设置发票登记本，登记购入发票的数量、号码，开出的发票号码、日期、客户、金额、领取人，送给客户要客户回签，避免麻烦。