由于新公司法对异议股东股份回购请求权规定的比较简略，所以对适用中的一些问题还需结合立法目的、宗旨以及公司法一般原理进行探讨和分析。以下着重围绕其中的几个问题进行讨论：

1.对于行使请求权受阻时的救济措施，法律仅在第七十五条针对有限责任公司作了规定，没有规定股份有限公司的股东是否同样适用，应如何理解?第一百四十三条是在公司回购的几种情形中涉及了异议股东股份回购请求权问题，出于立法技术上的考虑，没有专门规定此种情形下是否应当赋予异议股东诉权。但是从其所要解决的问题及制度的运行机理来看，与有限责任公司异议股东行使股份回购请求权并无本质的区别，因而应该允许股份有限公司异议股东在行使请求权受阻时享有同样的诉讼权利。这样理解应当是契合立法本意的。

2.第一百四十三条中规定了股份有限公司中异议股东请求股份回购后公司应当在六个月内将所收购的股份进行注销或者转让，但在有限责任公司的立法中则不置可否，应如何理解?对此问题，应结合公司法理给予分析。应当说，尽管第七十五条并未专门规定有限责任公司回购自身股份后是否应当及时处理，但是如果公司长期持有自己的股份不仅与公司基本法理相冲突，而且可能侵害债权人的合法权益、导致公司与股东之间的不当利益竞争。故而，有限责任公司异议股东行使其请求权后，公司所收购的股份也应及时处理。此时应可准用第一百四十三条的相应规定。

3.第一百四十三条规定股东因对股东大会作出的公司合并、分立决议持有异议，而不像第七十五条那样表述为请求权股东应为对该项决议投反对票的股东，二者认定上有无不同?对此问题的解释，不能仅从字面出发，而应结合异议股东股份回购请求权制度设置的目的出发来分析。依据公司法的基本原理，该制度的设立主要是为了切实维护在表决过程中受到资本多数决不当影响的中小股东的合法权益。换言之，是考虑到其在决策过程中所处的弱势地位而给予的一项辅助性措施。虽然第一百四十三条未提及是否应当在股东大会决议过程中投反对票，但是基于法理也应当作肯定的理解。而且，需要指出的是，在法院认定是否属异议股东时，应当要求股东提供书面的证明材料。

4.在行使股份回购请求权的过程中，公平价格的确定是一项重心工作。究竟如何去确定交易的价格呢?正常状况下应当由公司与异议股东之间进行自由协商。而如果双方无法达成一致，则有权请求人民法院对价格进行裁量。法院应结合决议时公司经营发展的情况以及股东持股的具体情况进行综合考察，在尽可能地与双方沟通意见的基础上形成一个可接受的价格。需要注意的是：我国立法明确肯认了股东在不能达成协议时，有权在法定的期限内向法院起诉，但没有说明公司是否也可在协议无法达成时向法院请求确定合理的价格，那么应如何看待和处理这一问题呢?公司作为协商的一方当事人亦应有请求法院确定价格的权利，其原因是赋予公司请求法院确定公平价格并不损害异议股东的利益，而且也有利于促进价格争议的尽快解决。