如果男方患有乙肝的话，正常情况下，法院会将孩子的抚养权判给母亲。因为乙肝在一定程度上具有传染性，这并不利于孩子的健康成长。

一、小三阳能争取孩子的抚养权吗

对乙肝病毒携带者的婚姻、生育、就业和继续教育没有特别限制。根据相关法律法规：2岁以下的儿童，如果母亲患有传染病或其他长期不能治愈的严重疾病，且子女不适合与之共同生活，可以与父亲共同生活。乙肝不是慢性传染病或其他严重疾病，不能剥夺抚养子女的权利。乙肝一方可以争取孩子的抚养权，因为乙肝虽然是传染病，但有治愈的可能。

二、男方有乙肝能要孩子吗

一般情况下，男方有乙肝不能要孩子的抚养权。因为乙肝是具有传染性的疾病，不及时治疗会传染给家人。女方可以搜集证据来证明男方身患乙肝不适合跟孩子一起生活，并且向人民法院提起诉讼，提出更改抚养权。人民法院通常会按照有益于孩子的健康成长，维护孩子的权益为原则，作出判决。

三、非婚生子分手后，孩子的抚养权归谁

第一，非婚生的子女，在两岁以前通常由母亲抚养，除非母亲患有传染性疾病或者是其他比较严重的疾病，孩子不适合与其一起生活的。此外，如果孩子的母亲在抚养孩子过程中没有尽到义务的，也可能会将孩子的抚养权判给孩子的父亲。

第二，如果孩子已经年满八岁之后，可以遵从孩子的意愿。