农村合作医疗缴费后次年的1月1日开始生效，有效期截止到次年12月31日。现在农村合作医疗改革成新农村合作医疗了。新型农村合作医疗，简称“新农合”，是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。

农村医疗保险如何转移

农村居民进城落户后，在单就业的随同单继续参加城镇职工基本医疗保险；灵活就业的，以个人身份参加城镇职工基本医疗保险或城镇居民基本医疗保险，按现行政策规定缴费并享受医疗保险待遇，前后缴费年限合并计算。农村居民进城落户需参加城镇基本医疗保险的最低年限、具体办理程序由落户地设区市人民政府确定，报省人力资源和社会保障厅备案。各统筹地区应按规定，及时做好落户农村居民参加城镇基本医疗保险的转移接续工作。

《社会保险法》第二十五条

国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。

城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。

享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。