环境行政处罚立案后不处罚的情况也是存在的，具体理由如下：

1、《环境行政处罚办法》

第五十一条【处罚决定】本机关负责人经过审查，分别作出如下处理：

(1)违法事实成立，依法应当给予行政处罚的，根据其情节轻重及具体情况，作出行政处罚决定；

(2)违法行为轻微，依法可以不予行政处罚的，不予行政处罚；

(3)符合本办法第十六条情形之一的，移送有权机关处理。

2、《行政处罚法》

第38条调查终结，行政机关负责人应当对调查结果进行审查，根据不同情况，分别作出如下决定：

(1)确有应受行政处罚的违法行为的，根据情节轻重及具体情况，作出行政处罚决定；

(2)违法行为轻微，依法可以不予行政处罚的，不予行政处罚；

(3)违法事实不能成立的，不得给予行政处罚；

(4)违法行为已构成犯罪的，移送司法机关。

一、环境行政处罚案件会立案的情形

《环境行政处罚办法》

第十六条涉嫌违法依法应当由人民政府实施责令停产整顿、责令停业、关闭的案件，环境保护主管部门应当立案调查，并提出处理建议报本级人民政府。

第二十二条【立案条件】环境保护主管部门对涉嫌违反环境保护法律、法规和规章的违法行为，应当进行初步审查，并在7个工作日内决定是否立案。

经审查，符合下列四项条件的，予以立案：

(一)有涉嫌违反环境保护法律、法规和规章的行为；

(二)依法应当或者可以给予行政处罚；

(三)属于本机关管辖；

(四)违法行为发生之日起到被发现之日止未超过2年，法律另有规定的除外。违法行为处于连续或继续状态的，从行为终了之日起计算。