主要有以下区别：1、房产税的征税对象是房屋，然后按照房屋的计税余值，或租金收入为计税依据，向产权所有人征收的一种财产税。契税的征税对象则是所有权变动的房地产，向产权人征收的一种财产税。2、房产税每年都要交，而契税只在房屋转让时缴纳。3、房地产税税率一般为12％和1．2％，契税税率为3％到5％。

房产税和契税的关系

房产税和契税没有特别的关系，二者是不同的税种，房产税和契税的区别体现在如下方面：

1．征税对象区别

房产税是向卖房人征收的，契税的征税对象是境内转移土地、房屋权属的承受人。

2．缴税范围区别

房产税限于城镇的经营性房屋，不包括农村；契税范围不限制，只要发生买卖房屋的交易就会产生契税缴纳义务。

3．计税方法区别

房产税对于自用的按房产计税余值征收，对于出租、出典的房屋按租金收入征税。契税以不动产的价格为计税依据，按不同的权属转移方式进行计税。

4．税率区别

房产税的税率通常有12％和1．2％两种，依据自用和出租的不同来定；契税一般实行3％－5％的幅度比例税率，各省、自治区、直辖市人民政府可以在幅度范围内自行确定。

《中华人民共和国房产税暂行条例》第三条：房产税依照房产原值一次减除10％至30％后的余值计算缴纳。具体减除幅度，由省，自治区，直辖市人民政府规定．没有房产原值作为依据的，由房产所在地税务机关参考同类房产核定。房产出租的，以房产租金收入为房产税的计税依据．