军人叛逃罪与逃离部队罪都有离队不归的行为，在定罪上可能发生混淆。其主要区别有以下几点：

1、军人叛逃罪侵害的是国防安全秩序，而逃离部队罪侵害的是兵役秩序。

2、军人叛逃罪的行为人必须逃亡到境外，而逃离部队罪的行为人并不要求逃往境外。

3、主观方面，军人叛逃罪的行为人在主观上具有背叛国家的目的，而逃离部队罪的行为人在主观上仅有逃避服兵役的目的。

军人叛逃到境外的行为本身必然包含了逃离部队、逃避服兵役的行为，因此在适用法律上，应根据重罪吸收轻罪的原则，以军人叛逃罪论处，不能再定逃离部队罪实行数罪并罚。

军人的职责是保卫祖国和人民的利益，如果他们以反对社会主义制度、危害祖国和人民利益为目的逃往境外的，不仅违背了军人的职责，同时对国家安全和国家利益也造成了危害，因而对这种行为必须依法追究刑事责任。这种犯罪行为既包括从境内逃往境外，也包括合法出境而在境外叛逃。