个人所得税应纳税所得额，是按扣除五险一金之后的工资计算，每月的奖金是不扣除的。某人月工资2000元，奖金1000元，那么其应纳税所得额就是3000（2000＋1000）元。个人所得税是按扣除五险一金之后的工资计算：应纳税所得额＝工资收入金额－各项社会保险费－起征点（3500元）；应纳税额＝应纳税所得额x税率－速算扣除数。

个人所得税扣除专项费用以后的税率是多少

不超过1500元的，税率为3％；超过1500元至4500元的部分，税率为10％；

超过4500元至9000元的部分，税率为20％；超过9000元至35000元的部分，税率为25％

超过35000元至55000元的部分，税率为30％；超过55000元至80000元的部分，税率为35％；

超过80000元的部分，税率为45％。

综合上面所说，个人所得税申请退税只要所提交的材料合理、合法那么到账的时间是非常的快，只要提交了所有材料之后就可以到网上查询退税的进度，从而确保自己的退税费及时的到账，但如果遇到自己的税费缴纳的过少，那么也是需要进行补交税费的。

《个人所得税法实施条例》第二十五条规定按照国家规定，单位为个人缴付和个人缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、住房公积金，从纳税义务人的应纳税所得额中扣除。