根据专利法和实施细则的规定，专利管理机关可以处理的专利纠纷有：

专利侵权纠纷；有关发明专利申请公布后，专利权授予前，他人实施发明的费用纠纷；

专利申请权和专利权归属纠纷；关于对职务发明人奖励和报酬的纠纷。

专利管理机关对上述纠纷所作出的处理决定，当事人不服的，可以向专利管理机关所在地的中级人民法院起诉，当该法院对专利案件无管辖权时，当事人可以向专利管理机关所属省、自治区、直辖市人民政府所在地的中级人民法院起诉。双方当事人在规定的期限内没有向人民法院起诉的，专利管理机关的处理决定即发生法律效力。

专利管理机关对侵权行为作出的处理决定，当事人期满不起诉，又不履行的，专利管理机关可以请求人民法院强制执行。