技术合同备案免税流程是在网上注册、填写合同、合同盖章、经过认定登记、合同审核、免税手续。技术合同备案是在当地的科学技术管理行政部门进行办理备案。

一、技术合同备案免税流程

技术合同备案免税流程如下：

1.网上注册。申请人应将本单位的营业执照和机构代码证的原件副本、写有联系人姓名、联系电话等提交给相关部门进行注册，经审核信息无误后，为申请人开通登记用户。

2.填写技术合同文本。申请人凭用户名和密码登录相关职能部门网站，进行技术合同示范文本的电子模板，按格式条款填报。

3.合同打印盖章。合同内容要求双面进行打印(复印)，并加盖公司骑缝章。企业盖章页与登记认定页，合为正反面一页。合同双方公司盖章、双方法人代表签字或盖章。

4.认定登记。申请人网上登录后进行技术合同信息的相关内容填报并提交，同时将书面技术合同文本，送达区科委技术市场管理办公室，进行认定登记。

5.合同审核。技术开发和技术转让合同经相关部门初审后，申请人还须将技术合同文本送达上一级职能部门进行审核盖章。

6.税务部门流程：提交相关材料到税务部门办理免税手续。

二、技术合同备案在哪里备案

技术合同备案到当地的科学技术管理行政部门办理备案，法律规定科学技术部管理全国技术合同认定登记工作。省、自治区、直辖市和计划单列市科学技术行政部门管理本行政区划的技术合同认定登记工作。地、市、区、县科学技术行政部门设技术合同登记机构，具体负责办理技术合同的认定登记工作。

三、技术合同备案有时间要求么

技术合同备案有时间要求的，必须在30天内办理完成。根据《技术合同认定登记管理办法》第十四条技术合同登记机构应当自受理认定登记申请之日起30日内完成认定登记事项。技术合同登记机构对认定符合登记条件的合同，应当分类登记和存档，向当事人发给技术合同登记证明，并载明经核定的技术性收入额。对认定为非技术合同或者不符合登记条件的合同，应当不予登记，并在合同文本上注明“未予登记”字样，退还当事人。