卵圆孔封堵术的医保报销比例如下：

1、在一个结算年度内，发生符合报销范围的，医疗费在10万以下，三级医院起付标准为650元，报销比例为50％，上限为2000元；

2、二级医院起付标准为300元，报销比例为60％；

3、一级医院不设起付标准，报销比例为65％。

《社会保险法》第二十八条

符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。

第二十九条

参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。

社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。