发包人已组织验收并在相关文件上签字确认验收合格，后又以工程质量存在瑕疵为由，拒绝支付或要求延期支付工程价款的，该主张不能成立。但确因承包人施工导致地基基础工程、工程主体结构质量不合格的，发包人仍可以拒绝支付或要求延期支付工程价款。

一、建设工程合同无效后的处理与认定方式

1、建设工程施工合同在尚未履行前被确认无效：双方当事人均不能再继续履行。若一方因准备履行合同有损失，则按照双方导致合同无效的过错程度进行赔偿。

2、建设工程施工合同所约定的工程已经开工但尚未完工时被确认无效：一是应当立即停止履行。

二是若已完工程质量验收合格，发包人应参照无效合同与承包人结算并付款；若已完工程质量验收不合格且无法修复，则承包人应该予以拆除，并向发包人返还已付工程款。

三是有过错的一方应当赔偿对方在准备签订、签订合同、履行合同支出的费用，包括直接费用和间接费用；双方都有过错的，按过错大小各自承担相应赔偿责任。

3、建筑工程合同履行完毕后被确认无效：首先，建设工程竣工验收合格的，发包人应该参照合同约定与承包人结算并支付工程款。其次，建设工程竣工验收不合格但修复后合格的，发包人应该参照合同约定与承包人结算并支付工程款。

最后，建设工程竣工验收不合格且修复后仍不合格的，发包人不支付承包人工程款，承包人应予以拆除并返还以收到的工程款；同时按照各自过错大小分担包括签订、履行合同和合同被确认无效后的后续费用，如拆除质量不合格的建筑物的费用、工程延期费用、材料费等。

二、发包人提供材料不合格，导致无法继续施工，如何结算

因发包人提供材料不合格导致无法继续施工的，对于已完成的验收合格的工程，承包人可要求发包人按照约定折价补偿。如验收不合格，修复后的建设工程经验收合格的，发包人可请求承包人承担修复费用，如修复后的建设工程经验收不合格的，承包人无权请求发包人按照合同约定约定折价补偿。

三、工程合同无效有什么法律后果？

建设工程合同无效的法律后果，司法解释和司法意见均有散见的规定。具体有以下情形：

1、建设工程经竣工验收合格的建设工程施工合同无效，但建设工程经竣工验收合格，承包人请求参照合同约定支付工程价款的，应予支持。

2、承包人超越资质等级许可的业务范围签订建设工程施工合同，在建设工程竣工前取得相应资质等级，当事人请求按照无效合同处理的，不予支持。

3、人民法院可收缴当事人已经取得的非法所得。

4、合同无效，但工程经竣工验收合格或交付使用，但合同价款约定不明的，应当按工程定额、工程量对工程造价进行鉴定，以鉴定结果确定工程价款。

5、合同无效，工程竣工验收合格，发包人要求扣除工程折价款中所含利润的，人民法院不予支持。

6、合同无效，发包人与承包人达成的结算协议有效。