去女方办理结婚证的话，对以后在男方这边生孩子上户口没有影响。规定是两人领取结婚证，可以到两人任何一方户籍所在地民政部门申请办理。以后给新生儿上户口，规定是凭孩子出生医学证明可以在婴儿常驻地区申请办理。

结婚登记一定要在户口所在地办理吗

男女双方办理结婚登记的，一定要在户口所在地，并且要男女双方共同在一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关登记。办理结婚登记的男女双方要符合结婚的条件，婚姻登记机关在查明双方的相关证件之后，办理结婚登记手续，发给结婚证。

《中华人民共和国民法典》第一千零四十九条要求结婚的男女双方应当亲自到婚姻登记机关申请结婚登记。符合本法规定的，予以登记，发给结婚证。完成结婚登记，即确立婚姻关系。未办理结婚登记的，应当补办登记。