不可以，农村合作医疗不能报销工伤，即是不报工伤，他也不包含意外伤害。

一、工作中感染疾病算工伤吗

工作期间得了疾病是不属于工伤的，法律上规定在工作时间患职业病的可以认定为工伤，但疾病是不属于职业病的范围，所以不可以认定为工伤，具体情况下应当由工伤认定部门来进行处理。在司法实践中，对于工伤认定的具体情况应当基于实际来进行处理，如果对相关情况的认定存在异议的，或者工伤本身就不成立的，那么是不可以按照工伤的标准来进行报销和赔偿的，这种情况下就只能由当事人自己进行医疗和处理的。

二、工伤可以报销农保吗？

工伤农合不可以报销。我国法律规定，如果职工参加了工伤保险的，则工伤的医疗费用由工伤保险基金进行支付；如果没有参保，则由所在单位进行支付。医疗保险基金是不支付工伤的医疗费用的。若当事人对不是因为工作而负伤的事实说谎，从而使用了新农合报销工伤医疗费用，则是属于诈骗医疗保险基金的违法行为。

三、工伤农合可以报销吗

工伤农合不可以报销。我国法律规定，如果职工参加了工伤保险的，则工伤的医疗费用由工伤保险基金进行支付；如果没有参保，则由所在单位进行支付。医疗保险基金是不支付工伤的医疗费用的。若当事人对不是因为工作而负伤的事实说谎，从而使用了新农合报销工伤医疗费用，则是属于诈骗医疗保险基金的违法行为。