双方当事人有约定仲裁的，建设工程合同纠纷可以申请仲裁。双方当事人因建设工程合同发生纠纷，然后想要去仲裁委员会申请仲裁的，必须要有仲裁协议，没有仲裁协议的，不可以申请仲裁，发生纠纷的，只能向人民法院提起诉讼。

一、处理合同纠纷的方法有哪些

处理合同纠纷的方法如下：

1、双方应本着相互理解、相互让步的精神，自愿协商解决；

2、第三人居中调解。如果合同发生纠纷，当事人可以要求协议条款约定的单位或人员居中调解；

3、向仲裁委员会申请仲裁。双方不愿意协商、调解、协商、调解的，可以仲裁或者诉讼；

4、向人民法院提起诉讼。合同发生纠纷后，当事人自行协商调解不成的，合同中没有仲裁条款，事后未达成仲裁协议的，可以向人民法院提起诉讼。

二、购房合同纠纷找哪个部门处理

购房合同纠纷是一种民事纠纷，因此是属于民事案件，双方发生纠纷，其中一方可以向人民法院提起诉讼，请求人民法院帮你们解决纠纷。但你们有仲裁协议的或者在购房合同中有约定仲裁事项的，可以向仲裁委员会申请仲裁，请求仲裁委员会帮你们解决纠纷。有仲裁协议并且仲裁协议有效的，是需要先经过仲裁的，不能直接向人民法院起诉。

三、遇到合同纠纷该怎么能解决

遇到合同纠纷，可以按照以下方法来解决：1、当事人愿意调解的，可以去人民调解委员会进行调解；2、当事人在签合同时，或者发生纠纷后，双方有约定仲裁协议的，可以去仲裁委员会申请仲裁；3、未约定仲裁协议的，当事人可以去人民法院提起诉讼，请求人民法院对纠纷作出判决，人民法院对合同纠纷进行审理后，应当为当事人作出正确的判决。