一、合同纠纷发生后应当如何选择仲裁申请的方式

合同纠纷仲裁程序如下：

1．到约定的仲裁委申请仲裁，提交书面的仲裁申请书、仲裁协议；

2．仲裁委对于可以立案的案件，出决定，如果决定立案的，五日之内会发出相关书面通知；

3．仲裁委将仲裁规则和仲裁员名册送达申请人；

4．组成仲裁庭，当事人参加仲裁。

《仲裁法》第二十一条

当事人申请仲裁应当符合下列条件：

（一）有仲裁协议；

（二）有具体的仲裁请求和事实、理由；

（三）属于仲裁委员会的受理范围。

第二十二条规定，当事人申请仲裁，应当向仲裁委员会递交仲裁协议、仲裁申请书及副本。

二、民事合同纠纷诉讼时效是多久

民事合同纠纷诉讼时效是三年。

根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。

诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

三、合同纠纷管辖

合同纠纷可以由当事人书面协议选择与争议有实际联系地点的人民法院管辖，没有约定的，由被告住所地与合同履行地的人民法院管辖。

根据《民事诉讼法》第二十三条规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。

第三十四条规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。

《中华人民共和国农村土地承包经营纠纷调解仲裁法》：第三章　仲裁 第四节　开庭和裁决　　第三十四条　仲裁庭作出裁决前，申请人撤回仲裁申请的，除被申请人提出反请求的外，仲裁庭应当终止仲裁。