跨省的合同纠纷，双方可以先协商处理，协商不成的，可以向法院起诉处理。

向法院起诉的，如果合同中有约定管辖法院的，则可以向有管辖权的法院起诉处理。如果没有约定的，则由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。

一、如何确定借款合同纠纷案件管辖

确定借款合同纠纷案件的管辖法院的办法：如果当事人依法订立了书面协议，约定由原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖的，则按约定来确定管辖法院；如果当事人未约定的，则由被告住所地或者合同履行地的人民法院管辖。

二、代签合同需注意哪些问题

合同是双方同意后签订的明确双方权利义务的协议，包括劳动合同、租赁合同、销售合同等合同。注意合同中的几个问题：

1、担保问题；

2、预付款问题。预付款是一方根据合同约定在合同签订后提前支付一定数额的货币；

3、解决合同纠纷的办法。合同中有效仲裁条款的，只能申请仲裁，不得向法院起诉；合同中规定法院管辖权的，应当注意选定的管辖法院必须是合同履行地、签订地、被告住所地、原告住所地、标的物所在地的法院，不得违反专属管辖权和级别管辖权的规定；

4、合同的形式和内容。

三、股权转让纠纷管辖法院如何选择

按照我国《民事诉讼法》及最高院司法解释的规定，合同纠纷由被告住所地或合同履行地法院管辖。如果合同没有实际履行，当事人双方住所地又都不在合同约定的履行地的，应由被告住所地法院管辖。且法律赋予当事人协议约定管辖法院的权利，即合同的双方当事人可以在书面合同中协议选择与被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的法院管辖，但不得违反级别管辖和专属管辖的规定。在股权转让协议纠纷中，若双方当事人对管辖法院有约定且约定有效的，应适用其约定;没有约定或约定不明的，应适用法律规定，即由被告住所地或者合同履行地法院管辖。其中，合同履行地应为股权转让的目标公司的公司注册地，因为转让行为需向公司注册地的登记机关履行相应的手续方可完成。