怀孕期女方要求协议离婚的办理程序：

(一)申请。

协议离婚必须双方亲自到一方户口所在地的婚姻登记管理机关申请，不得委托他人代理。申请时各方应持户口证明、居民身份证明、所在单位或村、居民委员会出具的介绍信、、证等，以便登记管理机关查明当事人身份，确定管辖权。

(二)审查。

婚姻登记管理机关在受理当事人的离婚登记申请后，应当在进行审查，在审查过程中，应全面了解协议的内容，尤其是注意双方当事人请求离婚的意思表示是否真实，夫妻一方的生活困难帮助、分割财产及处理等事项是否合适。

(三)登记。

婚姻登记管理机关审查后，对符合的，应予登记，发给，注销结婚证;对于不符合法定条件不予登记的，应以书面形式说明不予登记的理由，夫妻关系从当事人领取离婚证时起解除。离婚的当事人一方不按照离婚协议履行应尽义务的，另一方可以向人民法院提起民事诉讼。

《民法典》第一千零七十六条【协议离婚】夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。

离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。