建立自然保护区后，如果要进行搬迁的，一般要对土地进行征收，而不是进行流转，只有承包的农村土地使用权和经营权才进行流转。

《中华人民共和国自然保护区条例》

第二十七条禁止任何人进入自然保护区的核心区。因科学研究的需要，必须进入核心区从事科学研究观测、调查活动的，应当事先向自然保护区管理机构提交申请和活动计划，并经自然保护区管理机构批准；其中，进入国家级自然保护区核心区的，应当经省、自治区、直辖市人民政府有关自然保护区行政主管部门批准。

自然保护区核心区内原有居民确有必要迁出的，由自然保护区所在地的地方人民政府予以妥善安置。

《农村土地承包法》

第九条承包方承包土地后，享有土地承包经营权，可以自己经营，也可以保留土地承包权，流转其承包地的土地经营权，由他人经营。

第三十六条承包方可以自主决定依法采取出租(转包)、入股或者其他方式向他人流转土地经营权，并向发包方备案。

一、农村土地征收和流转的区别

从定义上来看，土地流转是指拥有土地承包经营权的农户将土地经营权(使用权)转让给其他农户或经济组织，即保留承包权，转让使用权。而土地征用是指国家为了社会公共利益的需要，依据法律规定的程序和批准权限批准，并依法给予农村集体经济组织及农民补偿后，将农民集体所有土地使用权收归国有的行政行为。

土地流转指的是经营权，流转到期后在土地承包期内依然属于农户。而土地征用指的是土地使用权的转换，也就是征用后的土地农户不再享有使用权。

土地流转是在农村集体范围内，将土地承包经营权进行流转。而土地征收是以政府为实施主体，通过严格程序将村集体土地转为国有土地。土地流转和土地征收都是实现土地资源优化配置的重要途径。

土地流转是指农村土地承包人自愿将其拥有经营权的土地，转让与他人经营，一般仅限于转让用于农业用途。而土地征收是国家根据公益事业需要或城市建设的需要，经过相关机关批准，而强制向农民征收土地，征收后一般用于非农业建设。