副科级跨市调动级别一般不会降低。具体还需要看调动后单位的具体情况，一般会按照原级别安排适当的岗位和工作，保留原级别的职级待遇。跨地区调动一般是商调，在同性质及以下单位调动，原行政单位的可以调行政单位或事业单位，原事业单位调事业或企业单位。

《干部调配工作规定》第七条

各级人事部门可据下列原因之一，在国家机关和事业、企业单位之间调配干部：

（一）改善干部队伍结构进行的人员调整；

（二）满足国家重点建设、重大科研项目及国家重点加强部门的需要；

（三）充实基层单位，支援边远贫困地区和艰苦行业；

（四）补充国家机关和事业、企业单位人员空缺；

（五）安置因单位撤销、合并或缩减编制员额而富余的人员；

（六）调整现任工作与所具有的专业、特长不相适应的人员；

（七）解决干部夫妻两地分居或其他特殊困难；

（八）符合政策规定的易地安置；

（九）满足国家机关、事业、企业单位其他工作需要。