怀孕了在肚子里的胎儿是否可以进行亲子鉴定一直是一个备受争议的话题。亲子鉴定是通过比较DNA序列的相似性来确定亲子关系的方法，而胎儿是否可以进行亲子鉴定就取决于是否能够获得胎儿的DNA样本。目前有两种方法可以获取胎儿DNA样本，一种是无创产前基因检测，另一种是羊水穿刺或绒毛膜活检等创伤性的方法。在进行亲子鉴定前，有几个点需要注意。

1、非创伤性的无创产前基因检测

无创产前基因检测是通过从孕妇的血液中分离出胎儿的自由DNA进行分析，从而得出亲子关系的结论。这种方法不需要对胎儿进行任何创伤性的操作，对母婴安全较为保障。然而，无创产前基因检测只能确定亲子关系是否存在，无法确定具体的父子关系。因为在胎儿的自由DNA中，只能够检测到孕妇和父亲的DNA，无法区分父亲和其他男性的DNA。

2、创伤性的羊水穿刺或绒毛膜活检

羊水穿刺和绒毛膜活检是常见的产前基因检测方法，通过穿刺羊水囊或取出绒毛膜组织，分离出胎儿的DNA样本。这种方法可以明确父子关系，但是在操作过程中可能给母婴带来一定的风险，如感染、出血等。

3、需要医生指导

无论是无创产前基因检测还是创伤性的方法，都需要在医生的指导下进行操作。医生会根据具体情况评估母婴的风险，并根据亲子鉴定的目的和需求，选择合适的检测方法。

4、法律规定

在一些国家和地区，亲子鉴定有法律限制，对于未出生的胚胎或胎儿的DNA样本获取和使用可能存在限制。因此，如果您需要进行亲子鉴定，建议事先了解本地的法律规定。

总结：

目前可以通过无创产前基因检测或创伤性的羊水穿刺或绒毛膜活检等方法获得怀孕了在肚子里的胎儿的DNA样本进行亲子鉴定。然而，选择合适的方法需要医生的指导，并需遵守当地的法律规定。在进行亲子鉴定前，请先咨询专业医生与法律专家，选择最适合的方法和程序进行。