凭离婚协议房产证可以变更，但前提是双方已经办理了离婚登记。因为只有办理了离婚登记，离婚协议才会生效，对于生效的离婚协议才可以作为变更房屋产权的凭据。

离婚后双方可以持各自身份证，户口本，离婚证，离婚协议，房产证，契税证明，出让性质土地证，到住房所属房管部门办理房屋产权变更登记。

《民法典》第二百零九条

不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。