如果夫妻离婚，有两个孩子的，双方可以达成协议，协商不成的，应当由人民法院根据实际情况进行判决。

《民法典》第一千零八十四条规定：“父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。”

夫妻双方在离婚时，有两个孩子的，双方可以约定由一方直接抚养，另一方负担孩子的抚养费；也可以约定一人抚养一个。双方协商不成的，应当由人民法院进行判决，人民法院一般是会判决一人抚养一个，至于哪一方抚养哪一个，应当根据实际情况来确定；夫妻一方有特殊情况的，两个孩子都应当由一方直接抚养，另一方负担孩子的抚养费。

一、父母的探望权

《民法典》第一千零八十六条规定：“离婚后，不直接抚养子女的父或者母，有探望子女的权利，另一方有协助的义务。行使探望权利的方式、时间由当事人协议；协议不成的，由人民法院判决。父或者母探望子女，不利于子女身心健康的，由人民法院依法中止探望；中止的事由消失后，应当恢复探望。”

夫妻在离婚后，不直接抚养的一方有探望孩子的权利，双方可以对探望的时间和方式达成协议，双方协商不成的，应当由人民法院进行判决。

如果夫妻离婚时，有两个孩子的，可以先由双方达成协议，约定孩子由谁抚养，双方按照自身情况来达成协议。双方协商不成的，可以请求人民法院进行判决，人民法院一般会判决一人抚养一个，如果一方有不能抚养孩子情况的，两个孩子应当由一方直接抚养。