一、被执行公司申请破产怎么办

被执行公司的钱在强制执行中已被冻结的，如果法院受理该公司破产的申请后，执行法院应该中止执行，由执行申请人向受理破产的法院申报债权。同时，该被冻结的资金属于破产公司的破产财产，根据《企业破产法》的规定进行破产清算，对于破产债权，也需要根据《企业破产法》的规定进行清偿。

二、已经进入执行程序还能宣告破产吗？

执行过程中，对一些债权人申请破产的案件，人民法院受理以后，有时债务人可能会与债权人团体达成和解协议，经人民法院认可生效后，破产程序就会中止。在这种情况下，出现两种后果。

第一，破产宣告受到阻却。据此，清算组成立和接管财产的情况无从发生，债务人享有继续占有、使用和处分财产的权利。

第二，企业财产继续受破产法的保护，个别债权人不得向企业追索债务，个别请求企业给付财产的民事诉讼、民事执行程序以及相关的诉讼保全措施均不得进行。由此看来，如果执行机构在此阶段才知道被执行人进入破产程序的情况时，正确的做法应是对债务人的民事执行程序裁定中止执行。

法律依据：

《公司法》第一百八十七条规定：

清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，发现公司财产不足清偿债务的，应当依法向人民法院申请宣告破产。公司经人民法院裁定宣告破产后，清算组应当将清算事务移交给人民法院。