工程款发票是否征收个人所得税，需要看销售主体是什么类型的纳税人，具体情况有以下两点：

1、如果是工程队等个体工商户，开具工程发票需要申报缴纳个人所得税；

2、如果是工程公司，需要申报缴纳企业所得税，开具工程发票就不涉及个人所得税。

纳税人取得利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，按月或者按次计算个人所得税，有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次代扣代缴税款。

开具工程款发票的风险有哪些

1、发票先开，付款在后。一个需要引起重视的问题是发票的问题。目前很多发包人在付款的时候，为了防止承包人收到款后不给付发票，往往要求承包人提供相应的发票后再付款。而根据国务院《发票管理办法》第三条本办法所称发票，是指在购销商品、提供或者接受服务以及从事其他经营活动中，开具、收取的收付款凭证的规定，发票是收付款的凭证，也即提供发票的行为，将被认为是已经收到款项。

2、无正式授权，挂靠人收款。挂靠现象是工程施工领域中老生常谈，却又屡禁不止的问题。挂靠在工程建设中如此普遍，以致工程业主对此也见怪不怪，往往认可挂靠人也即实际施工人的地位，在施工企业提供相应的授权委托甚至没有正式授权手续的情况下，将款项以现金或其他方式支付给挂靠人，而施工企业因只是收取管理费，也放手让挂靠人收取、支用工程款。

《中华人民共和国个人所得税法》第二条下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：

（一）工资、薪金所得；

（二）劳务报酬所得；

（三）稿酬所得；

（四）特许权使用费所得；

（五）经营所得；

（六）利息、股息、红利所得；

（七）财产租赁所得；

（八）财产转让所得；

（九）偶然所得。

居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。