1、全面审计法。按现行工程定额顺序、施工顺序或竣工图纸顺序，对全部项目逐一进行审查的方法。优点是全面、细致、质量比较高，缺点是工作量较大、审查时间长。

2、对比审计法。用已建成工程预算或建成但已审查工程预算对比拟建同类工程的方法。

3、重点审计法。是对工程结算的重点进行审查的方法。一般指工程量大或造价高的工程结算，包括补充合同、估列工日的各项费用的审查。

4、运用建筑信息模型(BIM)分析法。是指在规划设计、建造施工、运维过程的整个或某个阶段，应用多维信息技术，进行系统设计、协同施工、虚拟建造、工程量计算、造价管理、设施运行的技术和管理手段。

一、工程结算审计的重要性

1、做好工程结算审计，有利于各级政府科学合理地控制项目投资。

2、做好工程结算审计，是进一步规范项目管理的有效手段之一。把好工程结算审计关，通过查阅资料、走访、实地勘察等多种方式，既有助于政府汇总建设项目情况，统计建设项目收益，更有利于政府完善固定资产台账，从根本上杜绝国有资金流失。

3、工程结算审计是工程造价控制的最后一关，审计质量的好坏直接影响到政府固定资产投资数额的大小，若不能严格把关将会造成不可挽回的损失。

二、工程结算审计的内容

1、审核竣工结算编制依据。编制依据主要包括：工程竣工报告、竣工图及竣工验收单;工程施工合同或施工协议书;施工图预算或招标投标工程的合同标价;设计交底及图纸会审记录资料;设计变更通知单及现场施工变更记录;经建设单位签证认可的施工技术组织措施;预算外各种施工签证或施工记录;合同中规定的定额，材料预算价格，构件、成品价格;国家或地区新颁发的有关规定。

2、审核工程量。工程量是决定工程造价的主要因素，核定施工工程量是工程竣工结算审计的关键。审计的方法可以根据施工单位编制的竣工结算中的工程量计算表，对照图纸尺寸进行计算来审核，也可以依据图纸重新编制工程量计算表进行审计。

3、审核施工企业资质。严格审核施工企业的资质，对挂靠、无资质等级及无取费证书的施工企业，应降低综合单价或审计确定综合单价及造价。

4、审核工程合同。工程合同审计是投资审计的一项重要内容，必须仔细查阅相关文件资料是否齐全、合法合规。当双方对合同文件有异议时，国内合同按国内合同文件顺序解释，国际工程，按照FIDIC合同文件顺序解释，特别是按FIDIC条款订合同，索赔费用应重点审计。