刑事案件中，一般不是法院退卷让公安机关补充侦查。法院负责审判工作，如果案件证据不足的话，应当是由检察院提出补充侦查。如果案件经过两次退回补充侦查，仍然证据不足，不符合起诉条件的，人民检察院应当作出不起诉决定。

一、两次补充侦查共多少个月

两次补充侦查2次的时间总共是不超过60天。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在1个月以内补充侦查完毕。补充侦查以2次为限。每次不得超过一个月。

审查起诉阶段的补充侦查包括以下几点：

1、即人民检察院审查起诉的案件，如果是公安机关侦查终结，需要补充侦查的，既可以决定将案件退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查，必要时可以要求公安机关协助。但对于人民检察院自行侦查终结的案件需要补充侦查的，则不能退回公安机关补充侦查。采用何种方式由人民检察院决定；

2、对于退回公安机关补充侦查的案件，应当在1个月内补充侦查完毕；人民检察院审查起诉的期限从案件补充侦查完毕移送起诉之日起重新计算。人民检察院审查起诉中决定自行侦查的，应当在审查起诉期限内侦查完毕；

3、补充侦查的次数不得超过两次。这既是指退回公安机关补充侦查的案件，也包括人民检察院决定自行侦查的案件；

4、经过补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。

二、如果案件一直查不清会怎么样

1、在检察院审查起诉阶段，认为犯罪事实不清、证据不足，需要补充侦查的，应补充侦查。对于补充侦查的案件，检察院仍然认为证据不足、不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。

2、在法院审判期间，如果证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。

三、证据不足被抓的案子怎么处理？

根据法律规定，在刑事诉讼中，公安机关侦查终结的案件，一律由人民检察院审查决定是否起诉。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。补充侦查以二次为限。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。如果被不起诉人在押，应当立即释放。