补充侦查与是否加重判刑之间并无关联，补充侦查只是刑事诉讼中对犯罪嫌疑人所涉嫌犯罪因证据不足，力求以最详实的证据规则，对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

一、检察机关批捕后有哪些情况可以不予起诉

检察院不起诉有三种情形：

1、证据不足不起诉：对于二次补充侦查的案件,人民检察院仍然认为证据不足,不符合起诉条件的,应当作出不起诉的决定。

2、法定不起诉：犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有《刑法》第十六条的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。

3、酌定不起诉：对于犯罪情节轻微,依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。

二、刑事案件两年立案后证据不足如何办

刑事案件立案后两年证据不足的处理办法是：一般不会判刑，检察院会退回公安机关进行补充侦查，对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

三、检察院针对证据不足的刑事案件多久撤案

检察院针对证据不足的刑事案件会在两个月内撤案。因为检察院可以退回要求公安机关补充侦查两次，每一次以一个月为限。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。