土地所强拆自建房的处理程序是：

1.拆迁人向房屋拆迁管理部门提出申请；

2.房屋拆迁管理部门签署意见报市政府法制办作出限期拆迁决定书；

3.送达决定书；

4.拆迁人向公证机关办理证据保全；

5.召开联席会制订执行措施并作好被拆迁人最后一次说服工作；

6.张贴强拆公告；

7.实施强制拆迁。

根据《行政强制法》第四十四条规定，对违法的建筑物、构筑物、设施等需要强制拆除的，应当由行政机关予以公告，限期当事人自行拆除。当事人在法定期限内不申请行政复议或者提起行政诉讼，又不拆除的，行政机关可以依法强制拆除。

一、合法强拆需要履行的程序

第一，被征收人与房屋征收部门在补偿方案规定的期限内达不成补偿协议，或者被征收房屋所有权人不明确。房屋拆迁管理部门在发放房屋拆迁许可证的同时，应当将房屋拆迁许可证中载明的拆迁人、拆迁范围、拆迁期限等事项，以房屋拆迁公告的形式予以公布。

第二，这时房屋征收部门会报请作出房屋征收决定的市、县级人民政府作出补偿决定，并送达给被征收人；

第三，被征收人收到房屋征收补偿决定后，在法定期限内不申请复议或者不提起行政诉讼，在补偿决定规定的期限内又不搬迁；

第四，由作出房屋征收决定的市、县级人民政府依法申请人民法院强制执行；

第五，人民法院收到申请后进行审查，符合法定条件的，人民法院依法作出准予执行裁定；不符合条件的，人民法院依法作出不准予执行裁定。

第六，强拆既可以由作出征收补偿决定的市、县级人民政府组织实施，也可以由人民法院执行，实践中大多数情况是由市、县级人民政府组织实施。