1．处分对象不同。政务警告的对象是国家公职人员，党内警告的对象是党员，对于既是国家公职人员又是党员的可能受到双重处分。

2．处分内容不同。

政务警告是行政处分的一种，行政处分的种类有六种，从轻到重依次为警告、记过、记大过、降级、撤职、开除。警告有提醒注意、不致再犯的意思，属于申诫处分。它可以是口头的，也可以是书面的，由处分机关选择适用。警告一般适用于轻微的行政违法行为，是行政处分中最轻的一种。

党内警告是党组织对党员的一种处分。党内处分分为：警告，严重警告，撤销党内职务；留党察看；开除党籍。党员受到警告或者严重警告处分，一年内不得在党内提升职务和向党外组织推荐担任高于其原任职务的党外职务。

党内警告处分，违纪档案会扣党员绩效吗

党内警告处分影响绩效和年终奖金。

应该根据年度考核结果发放13个月和绩效，党内警告处分当年的考核应该是不合格或者不定等次，这样是没有13个月和绩效的。具体你可以咨询你们上级主管单位或者上级人社部门，有专门负责处分这方面的。

《中华人民共和国公务员法》

第六十二条处分分为：警告、记过、记大过、降级、撤职、开除。

第六十四条公务员在受处分期间不得晋升职务、职级和级别，其中受记过、记大过、降级、撤职处分的，不得晋升工资档次。

受处分的期间为：警告，六个月；记过，十二个月；记大过，十八个月；降级、撤职，二十四个月。

受撤职处分的，按照规定降低级别。

《中国共产党章程》第四十一条对党员的纪律处分有五种：警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看、开除党籍。

留党察看最长不超过两年。党员在留党察看期间没有表决权、选举权和被选举权。党员经过留党察看，确已改正错误的，应当恢复其党员的权利；坚持错误不改的，应当开除党籍。

开除党籍是党内的最高处分。各级党组织在决定或批准开除党员党籍的时候，应当全面研究有关的材料和意见，采取十分慎重的态度。