违约金一般不用代扣个人所得税，商品房买卖过程中，房地产公司因未协调好与按揭银行的合作关系造成购房人损失而支付的违约金收入，应按照“其他所得”应税项目缴纳个人所得税，税款由支付违约金的房地产公司代扣代缴。

违约金应如何支付

1）违约金的支付应体现合理性。

违约金应如何支付，当事人可以依法请求仲裁机构或者法院予以适当增、减，从而保证支付违约金额同违约所造成的损失相符合，以体现违约补救的合理性。

当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。

（2）违约金的计算办法及支付期限应明确约定。

为了避免在违约金交付问题上发生争议，合同当事人还应在合同的违约条款中，明确约定违约金的计算办法、支付期限及迟交时利息的计算办法等。

《中华人民共和国个人所得税法》第二条第一款

下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：

（一）工资、薪金所得；

（二）劳务报酬所得；

（三）稿酬所得；

（四）特许权使用费所得；

（五）经营所得；

（六）利息、股息、红利所得；

（七）财产租赁所得；

（八）财产转让所得；

（九）偶然所得。