未申请土地经营权登记不会影响土地流转合同的效力，但未经登记，不得对抗善意第三人。

一、依法应当办理抵押登记的抵押权的生效时间为

1、不动产抵押权的生效《民法典》第402条规定，以下财产抵押的，办理抵押登记，抵押权自登记时设立：2、动产抵押权的生效《民法典》第403条规定，以下财产抵押的，抵押权自抵押合同生效时设立：3、浮动抵押权的生效《民法典》第403条规定，抵押权自抵押合同生效时设立，未经登记，不得对抗善意第三人。

二、商标使用许可合同有效吗？

依据商标法的规定，商标许可合同没有备案的不影响合同的效力，但出现纠纷时不得对抗善意的第三人。《中华人民共和国商标法》第四十三条：商标注册人可以通过签订商标使用许可合同，许可他人使用其注册商标。许可人应当监督被许可人使用其注册商标的商品质量。被许可人应当保证使用该注册商标的商品质量。经许可使用他人注册商标的，必须在使用该注册商标的商品上标明被许可人的名称和商品产地。许可他人使用其注册商标的，许可人应当将其商标使用许可报商标局备案，由商标局公告。商标使用许可未经备案不得对抗善意第三人。

三、动产抵押权什么时候生效

以动产抵押的,抵押权自抵押合同生效时设立。我国动产抵押权模式采用书面成立—登记对抗主义，即动产抵押权依当事人间的书面合同成立，但未办理抵押登记，不得对抗善意第三人。所谓不得对抗善意第三人，可以解释为办理抵押登记的抵押权具有对抗第三人的法律效力，即抵押财产登记后，不论抵押财产转移到谁手中，只要债务履行期届满债务人没有履行债务，抵押权人都可以就该抵押财产实现抵押权。