如果已经申请工伤认定，判定为工伤之后，手术费是可以进行报销的，所以员工可以先垫付之后，在申请劳动仲裁进行维权。员工在工作中发生事故受伤，应该按照工伤流程进行。工伤流程如下：

1、及时送往医院治疗。

2、申请工伤认定。单位在事故发生后一个月内申请，如果单位未按时申请，员工可以在事故发生后一年内申请工伤认定。

3、治疗及休息期。员工在医院治疗和休息期间，单位按月支付员工工资，工资保持原待遇不变。

4、劳动能力鉴定。员工在达到一定医疗期后，可申请伤残鉴定。

5、工伤待遇审核。员工在治疗完毕或者劳动能力鉴定结束之后可申请工伤待遇，报销医疗费用以及领取一次性伤残补助金等。

6、员工和单位解除劳动关系时，单位应该支付有伤残人员一次性就业补助金，社保支付一次性医疗补助金。