一、民事诉讼中被告已申请破产怎办

《企业破产法》第二十条，人民法院受理破产申请后，已经开始而尚未终结的有关债务人的民事诉讼或者仲裁应当中止；在管理人接管债务人的财产后，该诉讼或者仲裁继续进行。

二、破产程序优先原则在新破产法上主要体现在哪些方面

1、关于案件管辖，当法院受理破产申请后，受理破产案件的法院便拥有对关于该债务人的普通民事诉讼的优先管辖权，这意味着在此之后的关于该债务人的民事诉讼案件将只能向受理破产案件的法院提出。

2、关于诉讼参与人，法院受理破产申请后，已经开始但尚未终结的有关债务人的民事诉讼或者仲裁应当中止。在管理人接管债务人的财产后，将由管理人代表债务人参加该诉讼或者仲裁。而债权人在破产程序开始之后不得因其债权而单独提起诉讼或者申请强制执行，而应该统一进行债权申报，通过破产程序来满足债权。

3、关于执行程序的优先性，在法院受理破产申请后，破产程序应优先与普通民事诉讼、执行程序，因此有关债务人的财产保全措施应当解除，执行程序应当中止。破产程序相对于普通诉讼程序具有优先性，并不意味着其相对于所有与破产人相关的诉讼都有优先性，这里所指的普通诉讼一般仅限于为满足债权而提起的诉讼，如果不属于此类诉讼，则由于其与破产程序的诉求不一致而不必遵循破产程序优先的原则。

三、被告申请破产原告起诉有效吗

有效。法院受理企业破产案件后，企业有尚未终结的民事诉讼要中止，在管理人接管财产后，诉讼才能继续，所以破产单位是可以成为被告的。