我国在内部控制的理论研究与运用虽然起步较晚，但内部控制已成为当今国内理论界和实务界研究的一个重要课题，与国外优秀企业相比，我国企业内部控制的基础还十分薄弱，企业内部控制和风险管理还存在诸多问题，主要表现在以下方面：

1、内部控制系统薄弱且不受重视，内部控制环境关注不够

虽然大部分企业都建立了自己的内部控制制度，但对企业内部控制制度的理解，不同的企业有不同的理解，有的企业认为内部控制就是指管好钱物;有的企业认为提高经济效益与完善内部控制是对立的;有的企业落实内控制度时却大打折扣，有的企业内部控制制度内容不尽合理。产生的原因在于企业的管理阶层还没有意识到内部会计控制的重要性，没有真正转变观念，被动的进行内部控制，或者内部控制制度不完善，没有形成整体系统，缺乏有效的现代企业治理机制。

2、企业管理人员的基本素质相对较低

许多管理人员普遍未受过正规的专业教育，缺乏必要知识，不能正确地对费用的开支进行审批，管理人员特别是财务人员学历层次较低，造成会计信息失真，平时只重视货币资金管理、而忽略各类财产物资管理，造成财产物资内控管理严重不到位，也有一些会计人员虽有一定核算业务水平，但忽视对新业务和新的会计法规的学习，影响决策。

3、内部控制的执行与监督、检查、考核体制不健全

良好的企业内部控制不仅要求制度化，同时应配有相应的检查与考核制度。但有些企业内部控制制度的执行与检查流于形式，没有建立一整套的评价考核制度与奖惩制度。此外，企业内部控制的监督体制也不健全，各职能部门、各个岗位之间缺乏必要的协调与监督，导致各种信息不能得到快速传递与交流。

4、成本与效益影响内部控制制度的有效发挥

内部控制制度的建立与各种内部控制制度的关系，需要投入一定的人力和物力，较高成本的投入，内部控制的效果就会越好，根据管理的成本效益原则，当控制成本大于所产生的效益时，可能会放弃相应的控制措施，不能有效地控制一些不合理甚至是舞弊。