如果派出所主持调解时双方已经达成调解协议，对方不履行，可以起诉对方履行调解协议。《民事诉讼法》第二百三十六条发生法律效力的民事判决和裁定，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方可以向人民法院申请执行，也可以由审判员移送执行员执行。当事人必须履行调解和其他应当由人民法院执行的法律文书。一方拒绝履行的，对方可以向人民法院申请执行。

派出所调解案会留案底吗？

1、民事纠纷只是在派出所留有问询记录或调解记录，不叫案底。2、留有案底的是属于刑事案件。3、民事纠纷如果上升到刑事案件就要留案底了。根据《中华人民共和国人民调解法》的规定，人民调解员应当记录调解情况。人民调解委员会应当建立调解工作档案，将调解登记、调解工作记录、调解协议书等材料立卷归档。