一、申请执行超过两年怎么办

当事人向人民法院申请执行，必须在法定期限内提出。法定期限内当事人未提出申请的，即丧失了请求人民法院强制执行生效法律文书以实现实体权利的权利。

《中华人民共和国民事诉讼法》第二百三十九条对申请执行的期限作了一般性的规定，即“申请执行的期间为二年。申请执行时效的中止、中断，适用法律有关诉讼时效中止、中断的规定。”

同时，申请法院强制执行的期限也存在以下特殊情形：根据《最高人民法院关于执行若干问题的解释》(以下简称《解释》)第八十三条、第八十四条，对发生法律效力的行政判决书、行政裁定书、行政赔偿判决书和行政赔偿调解书，负有义务的一方当事人拒绝履行的，对方当事人可以依法申请人民法院强制执行。申请人是公民的，申请执行的期限为1年，申请人是行政机关、法人或者其他组织的为180日。

根据《解释》第八十八条，行政机关申请人民法院强制执行其具体行政行为，应当自被执行人的法定起诉期限届满之日起180日内提出。逾期申请的，除有正当理由外，人民法院不予受理。

根据《解释》第九十条，行政机关根据法律的授权对平等主体之间民事争议作出裁决后，当事人在法定期限内不起诉又不履行，作出裁决的行政机关在申请执行的期限内未申请人民法院强制执行的，生效具体行政行为确定的权利人或者其继承人、权利承受人在90日内可以申请人民法院强制执行。

二、导致申请执行时效中断的原因

所谓申请执行期间中断，是指在法定的申请执行期限内，申请执行期间因某种法定原因成就而重新开始计算。实践中，导致申请执行期间中断的原因很多，从大的方面可分为三类，即债权人主张权利、债务人履行义务、双方达成新的协议。

2、主动履行部分义务。法院裁决文书生效后，被执行人主动履行了部分义务，尚未履行其它义务。

3、双方和解重新约定履行义务的期限。法律文书生效后，被执行人在经济困难、暂无履行能力的情况下，可以主动与申请执行人协商，订立分期履行的协议。

4、其他导致申请执行期限中断的事由。申请执行时效中断的法律效果是，中断事由发生后，已经经过的时效期间全部作废，从中断事由发生后重新计算两年申请执行时效期间。由于法律对时效中断的次数没有限制性规定，根据时效制度的立法本意，申请执行时效期间重新起算后仍然可以依法中断，没有次数限制。

三、申请执行的条件

双方当事人必须履行人民法院发生法律效力的判决、裁定。纳税人或者其他税务当事人拒绝履行判决、裁定的，税务机关可以向第一审人民法院申请强制执行，或者依法强制执行。税务机关拒绝履行判决、裁定的，一审人民法院可以采取以下措施：

1、对应当归还的罚款或者应当给付的赔偿金，通知银行从该税务机关的帐户内划拨;

2、在规定期限内不执行的，从期满之日起，对该税务机关按日处五十元至一百元的罚款;

3、向该税务机关的上一级税务机关或者监察、人事机关提出司法建议。接受司法建议的机关，根据有关规定进行处理，并将处理情况告知人民法院;

4、拒不执行判决、裁定，情节严重构成犯罪的，依法追究主管人员和直接责任人员的刑事责任。

5、纳税人或者其他税务当事人对税务机关的具体行政行为在法定期间不提起诉讼又不履行的，税务机关可以申请人民法院强制执行，或者依法强制执行。